すべてのポケットにあるDNAシーケンサー

バイオテクノロジー企業は、人々が遠く離れたジャングル、海、さらには宇宙でさえ遺伝子を解読できるようにするデバイスを構築しています。彼らはまだ始まったばかりだと言っています。

国際宇宙ステーションに乗って、 6人 現在、時速17,000マイルで地球を周回しており、毎日15の日の出と日の入りを取り入れています。ビューは無敵です。浮かぶ感覚、崇高。

しかし、彼らに幸運を 彼らが病気になった場合 。

ISSには、病気を確実に診断したり、その背後にある微生物を特定したりできるものは何もありません。代わりに、病気の宇宙飛行士は、地上の医療スタッフに自分の症状を説明するために解決する必要があります。彼らは、自分たちの病気が細菌性なのか、ウイルス性なのか、それとも他の何かなのか、あるいはステーションの抗生物質の限られた供給を襲撃することが彼らに何か良いことをするのかどうかを確実に知る方法がありません。

宇宙飛行士が自分を悩ませているものの完全な遺伝暗号を解読できれば、問題のあるバグを特定し、それが薬物に対して脆弱かどうかを調べることができます。しかし最近まで、このシナリオは笑いながら非現実的でした。シーケンサーはすべてマイクロ波と冷蔵庫のサイズと重量でした。彼らは宇宙ステーションに乗ってカートに入れることは不可能であり、おそらく旅行を生き延びなかっただろう。

と呼ばれる英国の会社に感謝します オックスフォードナノポアテクノロジーズ 、それはもはや真実ではありません。

2014年の春、同社はMinIONと呼ばれるUSB電源のシーケンサーをリリースしました（min-ee-unではなくmin-eye-onと発音され、黄色でもかわいいものでもありません）。長さ4インチ、幅1インチ、重さ87グラムで、ほとんどのチョコレートバーやスマートフォンよりも小さいです。今年の初めに、私は1つを手に握り、さらにいくつかの余地を残しました。一人の科学者 それを次のように説明します ジャケットのポケットに入れて忘れることができるDNAシーケンサー。

最後に、宇宙に送ることができるほど小さいシーケンサーがあります、とNASAのエンジニアであるクリステンジョンは言います。持っている 地球行きのフライトシミュレーターでMinIONをテストしました 、彼女と彼女の同僚は、テストするためのいくつかのDNAサンプルと一緒に6月にISSに1つを送る予定です。微小重力で地上と同じように機能する場合、宇宙飛行士は最終的にリアルタイムで自分の健康状態を監視できます。これは、将来の野心的なミッションにとって非常に重要になる可能性があります。火星への航海では、抗生物質を補給する能力が失われます、と微生物学者のサラ・カストロは言います。私たちが持っているのは、私たちが制限されるものです。感染を適切に治療する方法を知るには、感染の原因を知る必要があります。

ミニオンを使用すると、宇宙飛行士は実験を行って見ることもできます バクテリアが微小重力にどのように反応するか 、最初にサンプルを固定剤に浸して地球に戻す必要はありません。そして、彼らは宇宙ステーションの空気、水、そして食物の中の微生物を研究することができました。現在、私たちは乗組員に、事実の6か月後に何を食べ、呼吸し、飲んでいたかを伝えています、とSarahCastroは言います。

1つのミニオンがオフワールドに向かっている間、他のミニオンはすでに世界中を旅しています。これらの小さなマシンとそのコンパニオンデバイスは、ゲノミクスの世界に革命を起こし、民主化し、設備の整った機関や研究所からそれを解き放ち、社会全体にリリースするように設定されています。 Oxford Nanoporeが成功すれば、人々は病院やジャングル、ヨット、セキュリティチェックポイント、教室、リビングルームでDNAの配列を決定できるようになります。しかし、歴史が示しているように、その道を歩むことは決して容易ではありませんでした。

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ナノポア まさにそれがどのように聞こえるかです：小さな穴。通常、これは小さなペグ型のタンパク質で、コアに中空のチューブがあり、幅はわずか数十億分の1メートルです。オックスフォードナノポアのデバイスでは、タンパク質は液体に沈められた合成膜の中にあります。膜に電圧がかかると、イオンが細孔を通って流れ、電流が発生します。しかし、何かが細孔を塞いでいる場合、たとえばDNAの鎖があれば、イオンが妨げられ、電流が低下します。

DNAの4つのビルディングブロック（または塩基）（A、C、G、およびT）は、それぞれ異なる方法でナノポアを流れる電流を変化させます。その電流を測定することにより、ティッカーテープのように細孔を通り抜けるDNA鎖の配列を解読することができます。

これは、科学者がDNA分子を増幅して多くの同一のコピーを作成し、それらのコピーを小さな断片に分割し、断片を個別に配列決定し、最後に断片化された配列をまとまりのある全体に組み立てる必要がある従来の配列決定とは劇的に異なります。それは、本を書き写し、細かく切り刻み、テープで留めて読むようなものです。対照的に、ナノポアシーケンシングは、損傷を受けていないテキストを表紙から表紙まで読むようなものです。 DNAは、増幅や断片化なしに穴から送られ、長時間の連続実行でシーケンスされます。

伝説はそれを持っています 、カリフォルニア大学サンタクルーズ校のDavid Deamerは、カリフォルニアの州間高速道路5号線を運転中に、1989年にこのアイデアを思いつきました。彼はそれによって非常に打たれたと言われているので、それを書き留めるために引っ張らなければなりませんでした。彼と彼の同僚がそれを示すのに10年かかりました 彼らはDNAを捕獲することができた 、それをナノポアに注ぎ、区別します さまざまな拠点 。そして、オックスフォードナノポアは、このテクノロジーに基づいて頑丈で実行可能なシーケンサーを作成するのにほぼ同じ時間を要しました。 （ディーマーと他のナノポアのパイオニアは、その技術諮問委員会に参加しています。）

月に行けますか

2005年に設立された同社の当初の計画は、他のシーケンサーと非常によく似たデバイスを製造することでした。GridIONと呼ばれる大きなかさばる箱は、あるブロガーの言葉では VCR-machine-circa-1992ルックを揺るがす 。それを縮小するというアイデアは、かつては 次世代シーケンスのすべてで最も正直な人 。 MinIONの起源について彼に尋ねると、彼は、シーケンス市場をリードするサンディエゴを拠点とする会社に言及して、イルミナに感謝することができます。私は彼らを倒す方法を必死に考えています。

以前の仕事で、ブラウンはSolexaという会社のDNAシーケンサーの開発を支援しました。この会社は、彼の希望に反して、2007年にイルミナに売却されました。この売却により、イルミナはシーケンスジャガーノートに変身しました。世界は、会社に業界でほとんど揺るぎない独占を与えています。 2009年に、 この巨像はオックスフォードナノポアに1800万ドルを投資しました 新興企業のテクノロジーを商業化する権利を求めて、彼らのCEOはONTの取締役会を観察する機会を得ました。彼は私が言ったことすべてをうんちした、とブラウンは言います。だから私は立ち去って考えます：それを機能させることができる最も簡単なものは何ですか、そしてそれはイルミナの箱のようには見えません。 （イルミナはこの話についてコメントすることを拒否しました。）

パーカーは、シーケンサーが望遠鏡のようになると予測しています。以前はブティックの科学機器でしたが、現在はおもちゃ屋で購入できます。

茶色 ミニオンを世界に公開 2012年2月、フロリダでの会議で。彼はほとんどの時間を従来のGridIONについて話し、最後の2つのスライドでは小さいデバイスについてのみ言及しました。ほとんどオチとして、彼は言います。そうでした メガトン発表 、ある科学者は言った。 別のツイート ：まるで百万人のように、力に大きな混乱を感じました を明らかにする 投資家は苦痛で叫んだ。ある熱狂的な仲間がブラウンのホテルの部屋に侵入しようとしました。

重要なことに、MinIONはOxfordNanopore製品でした。それは使用しました ナノポアシーケンシングのバリエーション それはイルミナとの会社の契約ではカバーされておらず、2人は2013年に彼らの経済的関係を断ち切りました。しかし、その間、オックスフォードナノポアはまた、科学界から不注意にそれ自体を切り離していました。フロリダで、ブラウンはミニオンが2012年末までになくなると主張していました。そうではありませんでした。同社は、長い遅延につながる製造上の問題に悩まされていました。さらに悪いことに、彼らは沈黙し、信頼性とサポートの両方を犠牲にしました。多くの疎外された科学者は、ミニオンをベーパーウェアとして書き留めました。

ブラウンは謝罪せず、批評家に注目したと伝えられています。 Cliveにはリストがあります。彼がそれを見ると言っている人々のリストは、それが出たときにMinIONを取得しません、 2013年に微生物学者ニック・ロマンを書いた 。彼が冗談を言っているかどうかはわかりません。指名されることを望まなかった別の遺伝学者は私に言った、技術への私たちのアクセスが恣意的に取り消される可能性があるので会社を批判することを心配している私たちの多くがいます。

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2015年には、歴史上最大のエボラ出血熱の発生が2年目になりました。 10,000人以上が亡くなり、さらに多くの人が感染しました。科学者と医療従事者は、エピデミックの封じ込めにおいて着実な進歩を遂げていましたが、1つの重要な要素が欠けていました。 エボラゲノム 。

発生時にウイルスの配列を決定することにより、科学者は診断テストとワクチンをより効果的に開発できます。さまざまな場所と時間のウイルスを比較することで、侵入している株の数と変異しているかどうかを判断し、それに応じて制御手段を計画できます。さまざまな患者のシーケンスを比較することで、誰が誰に感染しているかを把握し、それらの感染経路を減らすことができます。

しかし、エボラ出血熱の発生の過程で、 少数のウイルスゲノム シーケンスされていました。ウイルスは遠隔地を襲ったため、分析のためにサンプルを離れた研究所に送る必要がありました。理解できる、考えた ニック・ロマン 、しかし耐えられない。アウトブレイクサンプルがシーケンス施設に到着するのを待つのではなく、施設をアウトブレイクに連れて行ってみませんか？

オックスフォードナノポアが2014年2月に早期アクセスプログラムを介して最終的にMinIONをリリースしたとき、ローマンは登録した数百人の科学者の1人でした。 1,000ドルの預金と引き換えに、彼らはMinIONと定期的なフローセルの供給を手に入れました。これは、それぞれ512個のナノポアを含むシーケンサーを駆動する使い捨てウェーハです。これらの初期のバージョンは、出荷の問題、信頼性の低い試薬、および 技術的な問題 、何人かの科学者に欲求不満で彼らを捨てさせる。しかし、ローマンは固執した。

2014年6月、彼は、現在デバッグおよび改良されているMinIONを使用して、研究に成功しました。 に サルモネラ アウトブレイク バーミンガム病院で。そして2015年4月、彼の学生であるJoshua Quickは、不可解にもRibz、Chicken、Brisketと呼ばれる3つのミニオンを持ってギニアに旅行しました。彼はまた、3台のラップトップ、いくつかの化学試薬、遠心分離機、および実験室の仲間から盗まれたサーモサイクラーを持ってきました。 モバイル診断ラボ ちょうど2つのスーツケースに収まり、2つの小さな机の上に広げられます。到着してから2日以内に、クイックはエボラ出血熱のシーケンスを開始しました。

発生中、ミニオンはその価値を証明しました。従来、科学者は何百ものサンプルを収集して送り出し、数日または数週間後に結果が返されるのを待たなければなりません。これは遅いプロセスであり、流行の即時性には適していません。しかし、MinIONは結果をすぐに解き放ちます。ある例では、Quickは24時間以内にサンプルからシーケンスに移行しました。そして、これらの配列は、DNA鎖がナノポアを通過するとすぐにリアルタイムで出現します。そのデータが生成されると、分析可能になるとローマン氏は言います。これは、シーケンス処理へのよりインタラクティブなアプローチです。

6か月以上、 チームは142のエボラゲノムを配列決定しました 、彼らの同僚が発生の最後の痕跡を監視するために使用しました。昨年、Quickからポップアップラボを引き継いだLauren Cowleyが私に言ったように、疫学者がリアルタイムで正確に感染経路を追跡し、チェーンを傍受してウイルスのさらなる感染を防ぐことができるのを見ました。 。

世界保健機関は2016年2月にエピデミックの終焉を宣言しました。しかし、エボラ出血熱が衰退したのと同じように、別の敵が上昇しました。今年の大きな脅威は、蚊媒介性のジカウイルスです。これは、小頭症などの先天性欠損症に関連しています。ジカ熱は南北アメリカと太平洋に広がり、再び遺伝学者が追いついてきています。公に利用可能なシーケンスはおそらく約10または15あるとローマン氏は言いますが、いずれも発生が始まったブラジル北東部からのものではありません。サンプルにアクセスすることはロジスティック的に非常に困難であり、シーケンスのためにブラジルからサンプルを出荷することは非常に困難です、と彼は付け加えます。

もう一度、ローマンはシーケンサーをサンプルに持っていきます。彼のチームは1か月ほどで、キャラバンにMinIONやその他の実験装置を搭載し、北のベレンから東のサルバドールまで、ブラジル沿岸をドライブします。彼は、このロードトリップによって、ジカ熱の起源、アメリカ大陸に侵入する頻度、免疫系との相互作用、株の数、他のウイルスとの相互作用について詳しく知ることができると期待しています。現時点では、そのことを実感することはできません、と彼は言います。ジカウイルスについては、ほとんど知られていません。

このようなプロジェクトの選択肢は、MinIONだけではありません。 2013年、ある科学者グループがより伝統的なマイクロ波サイズのシーケンサーを航海しました サザンライン諸島周辺 、地球上で最も遠い陸地のいくつか。しかし、MinIONは非常に軽量で、堅牢で、応答性が高いため、作業が簡単になります、とLoman氏は言います。あるチームはそれをタンザニアの熱帯雨林に持ち込みました カエルを識別するために 。もう1つは、今年の夏にインド洋の海洋調査船に乗船することを計画しています。ジョンとカストロはそれを宇宙に送っています。

カリフォルニアの近所にいる汚い犬を特定するために、うんちを順番に並べたいと思っている人がいました。

その強みにもかかわらず、MinIONは、コストまたは電力のいずれにおいても、イルミナの最高級シーケンサーとの競争にまだ近づいていません。ウイルスやバクテリアの小さなゲノムを簡単にシーケンスできますが、動物や植物のはるかに大きなゲノムを処理するには遅すぎます。 （比較のために、ヒトゲノムは細菌の1000倍の大きさです 大腸菌 、そして小麦のゲノムはさらに5倍大きい。）

それはオックスフォードナノポアとして変わるかもしれません 高速モードを展開 —ハードウェアとソフトウェアのアップグレードにより、MinIONの速度が4〜7倍向上します。同社はまた、 PromethION —MinIONのより大きく、より悪いいとこ。大規模なシーケンシング用に構築されたその144,000のナノポアは、おそらく毎日120ギガバイトのデータを生成する可能性があります。これは40のヒトゲノムに相当します。これらの獣の最初のものはすでに出荷されており、さらに多くが続く予定です。

ただし、品質は量と同じくらい重要であり、精度の低さに対する懸念がMinIONを悩ませてきました。 リリース以来 。イルミナのシーケンサーのエラー率はわずか0.1％です。対照的に、ローマンはエボラ出血熱の研究で約10％のエラー率を示しました（ただし、各ゲノムを数回読み取り、結果を組み合わせると、エラー率は急落しました）。エラー率は今や私たちの手にある一桁のパーセンテージであり、私たちは限界に達していない、とブラウンは付け加えます。

テクノロジーはまた、より堅牢である必要があります。今のところ、フローセルは数か月間持続します。多くのアプリケーションには十分ですが、NASAの地球外の野心には十分ではありません。それらも高価です：あなたがそれらをまとめて買うならば、それぞれ500ドル。もし彼らがファイバーだったら、それは素晴らしいことだとローマンは言います。その規模の低下は実現不可能ではありませんが、オックスフォードナノポアには他にも心配すべき経済的懸念があります。 2月、イルミナ 訴訟を起こした 彼らに対して、イルミナの特許を侵害する特定のナノポアを使用していると主張し、CEOのSangheraが主張している ひそかに否定しました 。 （オックスフォードナノポア製品の商業的関連性が市場独占者によって公に認められたことは喜ばしいことです。）

これがライバルのナノポアシーケンサーが開発中であることを意味するかどうかは、誰の推測でもあります。 Oxford Nanoporeがそのような技術を生み出している唯一の企業であり、技術的および法的な課題を克服できたとしても、最後の1つの障害に直面します。血液や水をフローセルに滴下するだけでは不十分です。最初にサンプルを準備する必要があります。そのプロセスには、分子生物学のトレーニングは言うまでもなく、遠心分離機、サーモサイクラー、ピペットなどの化学薬品や機器が必要です。シーケンスの準備ができたら、As、Cs、Gs、およびTsの文字列を解釈するための専用のソフトウェアと専門知識が必要です。

つまり、MinIONはどこにでも移動できますが、誰も使用できません。または、少なくとも、まだです。

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VolTRAXとはどういう意味ですか？クライブブラウンに聞いてみます。何の意味もありません。私はちょうどそれを作りました、彼は答えます。ここでの仕組みは、名前が必要だと言っています。会社全体に沈黙があります。私は「これはどうですか？」と言います、そして彼らは皆それをうんちします。 「それで、あなたの提案は何ですか？」と言いますが、何もありません。だから私たちは私の名前で行きます、それは私たちがミニオンにたどり着いた方法です。

警察はあなたに指紋であなたの電話のロックを解除するように強制することができます

の語源 VOLTRAX 茶番かもしれませんが、その目的はそうではありません。 MinION用のこのドミノサイズのアドオンは、シーケンス用の生物学的サンプル（体液、土壌の綿棒など）を準備するように設計されています。微細なチャネルのネットワークを介して液体を移動させ、化学試薬を衝突させてDNAを抽出し、そのDNAをMinIONにロードします。ラボでは、シーケンスよりもサンプルの準備に多くの時間を費やしています、とLoman氏は言います。もしあなたが臨床サンプルをあなたのためにそれをすべて行うチップに落とすことができれば、そしてそれが大きな場合、それは非常に有利でしょう。

VolTRAXは、この夏、初期のユーザーに提供される予定です。 ジョン・ウェットン 、レスター大学の遺伝学者および法医学者は、さまざまな種のIDバッジとして機能するテルテール遺伝子をシーケンスすることにより、違法な野生生物の売買と戦うためにそれを使用したいと考えています。 自然保護論者はすでにこの技術を使用しています 、 として知られている DNAバーコーディング 、象牙の出所を追跡したり、寿司を装った鯨肉を特定したりします。しかし、サンプルは分析のために出荷する必要があり、結果を取り戻すには数週間または数か月を見ています、とウェットンは言います。傷みやすいものや、容疑者が拘留されている場合は、それを行うことはできません。しかし、その場でのテストでは、没収、逮捕、またはそれについて何かをすることができます。

ナノポアシーケンサーを使用すると、検査官は、絶滅の危機に瀕している類人猿とサルの牛肉または野生動物の肉の切り身の違いを知ることができます。彼らは、密猟者の疑いのある道具で血液を分析し、最後に切り取った動物の身元を明らかにすることができました。押収されたキャビアが合法的な魚種または絶滅危惧種のチョウザメに属している場合、彼らはうまくいく可能性があります。同じテストで、多くの深刻な野生生物犯罪の問題に答えることができます、とウェットンは言います。

それでもデータを解析するという重大な問題が残りますが、OxfordNanoporeにもその解決策があります。 Metrichor 、DNA配列を分析するための既製のアプリに接続できます。 Oxford Nanopore自体が開発したそのようなアプリの1つは、What’s In My Pot？と呼ばれています。また WIMP 。シーケンスを取り、それらが属する生物を識別します。 チームはすでにそれをフィールドテストしました 自分たちの建物の後ろにある下水で汚染された川からの微生物と、ニューヨークの大型トラックの後ろからの低温殺菌されていない牛乳。

サードパーティもMetrichorアプリを開発できます。これは古典的なiPhoneのアプローチです。 OxfordNanoporeのアプリケーションディレクターであるDanTurnerは、開発者キットを誰にでも提供すると言います。獣医会社はあなたの犬の血統をチェックできるアプリを開発しています。そして、カリフォルニアの近所で汚い犬を特定するためにうんちを順番に並べたいと思っている人がいました。

このサービスはクラウドベースであるため、Oxford Nanoporeが望むように、インターネット接続とMinIONを持っている人なら誰でも、どこでも、何でもシーケンスできます。実験室も実験室のスキルもなければ、酪農家は自分たちの牛乳の品質を監視することができました。宇宙飛行士は彼らの空気と水を精査することができます。スーパーマーケットチェーンは、食物連鎖の中で危険なバクテリアをチェックすることができます。

なぜ自殺隊は悪かったのか

ゲノミクスの第二紀を迎えています。

生徒もシーケンシングを試すことができます。コロンビア大学では、 ソフィー・ザアイジャー 最近ゲノミクスコースを開発しました ここでは、学部生と修士課程の学生が、ニューヨークのレストラン、スーパーマーケット、Zaaijerのお弁当箱から取った食品のサンプルを順番に並べました。次に、WIMPを使用して微生物を特定しました。通常、そのような学生は理論を学び、データを操作するだけです。今回、彼らは本当にテクノロジーに接続することができた、とZaaijerは言います。彼らはこの装置を持っていて、DNAが毛穴からリアルタイムで読み取られているのを見ることができました。

同様の計画が世界中で進行中です。遺伝学者によって実施された教育者の調査では カレン・ジェームス 、回答者は、ナノポアシーケンサーを使用して、学部生、学校の学生、一般の人々に、マオリのマントの羽から、サファリパークの動物の糞、自分の鼻まで、あらゆることを研究してもらうことを夢見ていました。すべての学校にMinIONがあり、インターネットにデータをストリーミングしている場合…その影響は絶対に気が遠くなるようなものです、と言います ジョーパーカー キューの王立植物園から。しかし、市民科学者にとって魅力的であるためには、価格を下げる必要があります。

しかし、彼は楽観的です。 10年前、このナノポアのことについては、いくつかのSF作品が浮かんでいました。 5年前、オックスフォードナノポアからは誰も連絡がなく、多くの人が彼らが去ったと思っていました。今、私たちはそれが間違いなく機能することを知っています。ボールはコートにあり、価格を下げてスケールアップできることを示しています。

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クリス・グリフィンは、背中の悪い医者に行ったとき32歳で、慢性骨髄性白血病の診断を受けました。ありがたいことに、2つの薬（最初はイマチニブ、現在はダサチニブ）は、副作用を最小限に抑えて癌を抑制しています。 8年後、グリフィンは順調に進んでいます。彼はイギリスのキダーミンスターを拠点とする教育コンサルタントです。診断直後に結婚したパートナーの夫。そして4歳の男の子の父。私は普通の生活を送っています、と彼は言います。

しかし、彼は治癒していません。彼の病気は2つの染色体の異常な融合によって引き起こされ、彼の血球を制御不能に分裂させるBCR-ABLと呼ばれるキメラ遺伝子を作成します。それがダサチニブが阻害するものです。薬がまだ効いていることを確認するために、グリフィンは年に数回病院に行く必要があります。そうすれば、彼の医者は融合遺伝子を運ぶ細胞の数を測定することができます。旅行は彼の日々に食い込み、結果が到着するまでに数週間かかることがあります。そして、それらのドアを通り抜けるよりも、彼らがうまくやっていないことを誰かに思い出させるものはありません、とグリフィンは言います。

彼はいつも自分の家で快適にテストを行うことを夢見ていました。 糖尿病の人 自分の血糖値を監視できます。 1年前のロンドン会議で、彼はこの小さなデバイスを使ってステージでこのチャップを見たと彼は回想します。それがクライヴブラウンでした。

ブラウンは、死にかけている細胞によって血流に放出されるDNAの断片を分析するために、人々にナノポアシーケンシングを使用することについて話しました。癌研究者にとって、これは 循環DNAはリキッドバイオプシーとして機能します 、腫瘍が進行しているか、治療に反応しているか、薬剤耐性が進化しているかを明らかにすることができます。多くの企業、 イルミナが含まれています 、行動に参加し、がん検診のための血液ベースのツールを開発しています。

しかし、ブラウンは、MinIONとVolTRAXが十分に安価で正確になれば、人々は自分たちの循環DNAを自分で監視できると考えています。価格を桁違いに下げる必要がありますが、血液の内容のスナップショットを毎日撮ることができなかった理由はありません、と彼は私に言います。彼はDNAシーケンシングの世界と 定量化された自己 。私の意図は、人々が自分の生物学を理解し、それについて自分自身の推論を行うことができるツールを提供することです。

グリフィンはブラウンのビジョンを聞いてライトアップしました。多分彼は できる 最終的に彼自身のBCR-ABLレベルを監視し、データを彼の医師にアップロードするだけです。それが患者に与えることができる力...心理的に、それはとても重要だと感じます、と彼は言います。それ以来、彼はオックスフォードナノポアと連絡を取り合っており、テクノロジーにはまだ作業が必要であると彼らが保証しているにもかかわらず、彼は不安を感じています。私はモルモットになりたいと思っています。CMLを持っている最初の人が自宅で私の血液を監視しています。これは多くの人にとってすべてを意味すると思います。

毎日の監視により、症状が発生する前に感染の兆候が明らかになる場合もあります。そして、それはまだ尋ねられていない質問への答えを明らかにするかもしれません。ブラウン氏は、たった一人の人でさえ、長期間にわたって循環DNAを体系的にインベントリした人は誰もいないと言います。ベースラインは何ですか？現時点では不明です。しかし、データを取得することはできます。

DNAを血流からVolTRAXに取り込むという課題はまだあります。シンプルでばかげたサンプリングデバイスが必要です。ナノポアのすべてのガビンを含む消耗品の先端を備えたある種のペンです、とブラウンは言います。すでに濡れているもの（唾を一滴または少しの食べ物）に触れると、残りはあなたに代わって行われます。皮膚をやさしく刺したり、毛細血管から漏れて皮膚細胞間を循環する液体を採取したりすることができます。 Sangheraが先駆者として支援した血糖モニターは、すでに両方の方法を使用しています。

サンプリング装置を使用して、空気中のウイルスや食品生産ラインの細菌をチェックすることもできます。人間のオペレーターさえ必要ないかもしれません。定期的に収集するようにプログラムし、データをクラウドにアップロードするだけです。それはブラウンが呼ぶものを作るでしょう 生き物のインターネット ：センサーのネットワーク、世界のシーケンス。

すべてのビーフバーガーを追跡できるとしたらどうでしょうか。それは何ですか、どこから来たのですか、そして何が成長しているのですか？彼は尋ねます。空港を通過するすべての荷物に綿棒が外された場合はどうなりますか？または病院の空気供給？作物に何が起こっているのかを追跡したい植物育種家からの関心があります。ロンドン地下鉄で病原体をリアルタイムで検出したいと考えている防衛産業の誰かと話をしました。

今のところ、これらのアイデアは遠い、そしておそらく遠いもののようです。それからまた、5年前、またはそれ以前のポータブルシーケンサーの概念は、DNAを小さな穴に押し込むことによって読み取るというアイデアそのものでした。そもそもそれがうまくいくとは誰も信じていなかった、とブラウンは言います。オックスフォードナノポアが成功するかどうかにかかわらず、ジョーパーカーは、彼らの努力が競合他社にゲームを強化させ、停滞のリスクがある市場に新鮮な血を注入すると述べています。

結果がどうであれ、彼は私たちがゲノミクスの第二紀に入ると予測しています。シーケンサーは望遠鏡のようになります。以前はブティックの科学機器でしたが、現在はおもちゃ屋で購入できます。これにより、シーケンシングがユビキタスになるだけでなく、公開されているゲノム情報の量が大幅に増加します。それは、ほんの一握りの望遠鏡で天文学を行うことと、望遠鏡を持っているすべての人との違いだと彼は言います。それはあなたが見ることができる空の量を変えます。